Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TrdnE9Q9K5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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TrdnE9Q9K5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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TrdnE9Q9K5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TrdnE9Q9K5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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TrdnE9Q9K5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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TrdnE9Q9K5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms