Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col22a1E9Q7P1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms