Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20518E9Q548 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20518E9Q548 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20518E9Q548 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20518E9Q548 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20518E9Q548 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20518E9Q548 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20518E9Q548 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20518E9Q548 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20518E9Q548 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20518E9Q548 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20518E9Q548 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20518E9Q548 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20518E9Q548 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20518E9Q548 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20518E9Q548 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20518E9Q548 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms