Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc71lE9Q4T4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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