Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pgbd1E9Q492 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pgbd1E9Q492 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pgbd1E9Q492 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pgbd1E9Q492 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pgbd1E9Q492 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pgbd1E9Q492 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pgbd1E9Q492 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pgbd1E9Q492 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pgbd1E9Q492 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pgbd1E9Q492 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms