Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r238E9Q373 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms