Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms