Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Zfp558E9Q1J0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Zfp558E9Q1J0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Zfp558E9Q1J0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Zfp558E9Q1J0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Zfp558E9Q1J0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Zfp558E9Q1J0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Zfp558E9Q1J0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Zfp558E9Q1J0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Zfp558E9Q1J0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Zfp558E9Q1J0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Zfp558E9Q1J0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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