Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r68E9Q0V3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms