Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms