Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms