Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc144bE9PVZ3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms