Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Klhl3E0CZ16 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms