Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ5

Tmed7, Transmembrane p24-trafficking protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed7D3YZZ5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmed7D3YZZ5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmed7D3YZZ5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms