Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc8D3YZV8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms