Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms