Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prrt4B2RU40 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrt4B2RU40 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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