Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpruB1AUH1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpruB1AUH1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpruB1AUH1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpruB1AUH1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtpruB1AUH1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpruB1AUH1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpruB1AUH1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpruB1AUH1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpruB1AUH1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpruB1AUH1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpruB1AUH1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtpruB1AUH1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms