Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trabd2bB1ATG9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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