Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prr29B1ARI9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr29B1ARI9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms