Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Odf2A3KGV1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Odf2A3KGV1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Odf2A3KGV1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Odf2A3KGV1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Odf2A3KGV1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Odf2A3KGV1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Odf2A3KGV1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Odf2A3KGV1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Odf2A3KGV1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Odf2A3KGV1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Odf2A3KGV1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms