Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm6880A3KG45 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm6880A3KG45 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms