Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms