Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700023F06RikA2AB62 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700023F06RikA2AB62 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms