Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prdm16A2A935 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms