Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkd2l1A2A259 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms