Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 2,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Scn2aA0A0J9YTW6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Scn2aA0A0J9YTW6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Scn2aA0A0J9YTW6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Scn2aA0A0J9YTW6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Scn2aA0A0J9YTW6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Scn2aA0A0J9YTW6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scn2aA0A0J9YTW6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Scn2aA0A0J9YTW6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Scn2aA0A0J9YTW6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Scn2aA0A0J9YTW6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn2aA0A0J9YTW6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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