Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
B230359F08RikA0A0B4J1K3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms