Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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