Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms