Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trbv2A0A0B4J1G8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trbv2A0A0B4J1G8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trbv2A0A0B4J1G8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trbv2A0A0B4J1G8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trbv2A0A0B4J1G8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trbv2A0A0B4J1G8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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