Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Nrxn3-202ENSMUST00000110130 3654 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Slc2a9-210ENSMUST00000155634 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Ptges-202ENSMUST00000102852 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Ercc6-201ENSMUST00000066807 8423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Mkl2-201ENSMUST00000009713 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gja1-206ENSMUST00000220069 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Kif1b-201ENSMUST00000030806 6991 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 B3galt5-202ENSMUST00000113800 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm22095-201ENSMUST00000158984 150 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Vrk1-203ENSMUST00000085026 3711 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Enox2-203ENSMUST00000114912 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Adgrl3-218ENSMUST00000122037 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Nrxn3-201ENSMUST00000057634 4634 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 C79130-201ENSMUST00000199610 4296 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Tnfsf8-201ENSMUST00000030047 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Hist2h2be-201ENSMUST00000090781 2620 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Kcnma1-206ENSMUST00000163322 3162 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd11P23813 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms