Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rpusd2Q149F1 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Rpusd2Q149F1 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Rpusd2Q149F1 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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