Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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Sh3bp2Q06649 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Sh3bp2Q06649 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms