Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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PtpreP49446 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtpreP49446 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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