Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Zp2-201ENSMUST00000033207 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gng7-202ENSMUST00000099462 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Olfr923-203ENSMUST00000213619 2846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 4930428N03Rik-204ENSMUST00000224456 3212 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Dhrs7b-202ENSMUST00000108718 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm10118-201ENSMUST00000079279 2569 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Lrrc55-202ENSMUST00000111601 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Zfp260-201ENSMUST00000050735 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Slc25a30-201ENSMUST00000022580 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Srgap2-201ENSMUST00000097588 8026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Eny2-201ENSMUST00000060652 3000 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Arhgap19-202ENSMUST00000163265 5058 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Hoxd11P23813 Gm8049-201ENSMUST00000214336 1782 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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