Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccdc18Q640L5 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms