Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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NipblQ6KCD5 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NipblQ6KCD5 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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