Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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