Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Csmd1Q923L3 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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