Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Znf48Q3US17 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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Znf48Q3US17 Gm25235-201ENSMUST00000179933 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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Znf48Q3US17 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Znf48Q3US17 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Znf48Q3US17 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Znf48Q3US17 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Znf48Q3US17 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Znf48Q3US17 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Znf48Q3US17 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Znf48Q3US17 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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