Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Olfr577-203ENSMUST00000215237 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp9yF8VPU6 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC2.56□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC2.56□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Usp9yF8VPU6 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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