Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Gm3250E9Q1M3 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms