Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Alyref2Q9JJW6 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms