Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Lrrc43Q3V0L5 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms