Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm3238W4VSP7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm3238W4VSP7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm3238W4VSP7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm3238W4VSP7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Gm3238W4VSP7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm3238W4VSP7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm3238W4VSP7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm3238W4VSP7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3238W4VSP7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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