Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm26992S4R1A3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm26992S4R1A3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms