Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Homer1Q9Z2Y3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Homer1Q9Z2Y3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Homer1Q9Z2Y3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Homer1Q9Z2Y3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Homer1Q9Z2Y3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Homer1Q9Z2Y3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms