Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mbd3Q9Z2D8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd3Q9Z2D8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms