Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ap3b1Q9Z1T1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ap3b1Q9Z1T1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ap3b1Q9Z1T1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms